Test PCR

Pour une vision étayée en matière de tests, Aviation Covid Collective s’efforce de fournir aux intéressés plus d’informations sur les méthodes de diagnostic utilisées. La PCR est à la base des mesures prises vis-à-vis du virus SARS-CoV-2. Le test PCR constitue la base des statistiques sur le nombre de tests positifs, les personnes infectieuses, la valeur R, les admissions à l’hôpital, les admissions en USI, les décès et les nombreux modèles. Toutes les formes de tests sont calibrées sur la PCR.

Il vaut mieux que la fondation soit très solide. Une connaissance et une compréhension de base de la PCR, et en particulier des limites de la PCR, aideront à comprendre que nous prenons des raccourcis dans de nombreux domaines. Cela a des conséquences sociales énormes.

Qu’est-ce que la « PCR » ?

L’abréviation PCR signifie « réaction en chaîne par polymérase ». C’est une technique qui est utilisée dans divers laboratoires. Cette technique permet aux chercheurs d’amplifier une infime quantité d’ADN jusqu’à ce qu’il y en ait assez pour détecter, rechercher, utiliser ou analyser. Par exemple, la découverte de la PCR a considérablement fait progresser la recherche médico-légale. En bref, la PCR est une technique de laboratoire.

Comment ça marche?

Avec la PCR, un matériel génétique spécifique (un morceau d’ADN) peut être dupliqué au moyen d’une augmentation et d’une diminution contrôlées de la température. Cette étape de doublement s’appelle un « cycle ». Plus de cycles sont effectués, plus de copies du morceau d’ADN sont créées. Chaque cycle produit ainsi une augmentation exponentielle de la quantité de matériel génétique.

Pour indiquer à quelle vitesse le nombre d’augmentations est relatif à la quantité de matière de départ :

• 1 cycle : deux fois plus de matière ;
• 2 cycles : 4 fois
• 10 cycles : 1 024 x
• 20 cycles : 1 048 576 x
• 30 cycles : 1 073 741 824 x
• 40 cycles : 1 099 511 627 776 x
• 45 cycles : 35 184 372 088 832 x

Au moyen de la PCR, une quantité indétectable d’ADN peut être étendue à une quantité détectable. Y a-t-il de l’ADN présent que vous recherchez? Ensuite, vous pourrez trouver cela avec la PCR.

Le virus SARS-CoV-2 étant un virus dit à ARN, cet ARN doit être converti en ADN par des enzymes avant de pouvoir être multiplié. L’enzyme qui s’en occupe est appelée «transcriptase inverse» (RT). Pour cette raison, la RT-PCR est utilisée dans le cas de l’amplification de matériel viral à ARN.

Que montre la PCR ?

Un test PCR “positif” est la confirmation qu’un morceau d’ADN (gène) était présent dans l’échantillon de la personne testée. Il est testé pour la « présence » d’un gène sur la première ligne de défense de l’organisme, les muqueuses. Ni plus ni moins.

Le nombre de cycles requis avant que le gène spécifique puisse être détecté est appelé le « seuil de cycle » ou la valeur Ct. La valeur Ct fournit ainsi une indication de la quantité du gène recherché dans l’échantillon prélevé. En principe, avec une faible valeur Ct (moins de cycles), une plus grande partie du gène recherché était présente. Si de nombreux cycles étaient nécessaires avant que le gène puisse être détecté, la quantité initiale était faible.

Qu’est-ce que la PCR ne montre pas ?

Le noyau du coronavirus SARS-CoV-2 est constitué d’ARN, composé de nombreux gènes. Y compris les gènes N, S, E, RdRP et ORF1a/b. [1] La détection d’un seul morceau de gène, par exemple le gène E, ne signifie pas que tous les autres gènes nécessaires requis pour un noyau d’ARN intact sont également présents. Le noyau d’ARN du coronavirus est entouré d’une enveloppe protéique. Cela aussi n’est pas détecté par PCR. La PCR ne montre donc jamais par définition un virus intact.

Un test positif ne vous dit pas non plus si le virus est réellement entré dans vos cellules ou si le matériel viral se multiplie activement. Sans exclure la possibilité que d’autres agents pathogènes (tels que d’autres virus) soient présents, la cause des plaintes ne peut être attribuée à un seul résultat PCR positif. De plus, un test positif ne dit pas si vous êtes contagieux pour quelqu’un d’autre.

Un résultat de test PCR n’est donc absolument pas un diagnostic clinique en soi. Les fabricants de kits de test PCR sont très clairs à ce sujet dans la notice d’utilisation :

« Des résultats positifs indiquent la présence d’ARN du SRAS-CoV-2 ; une corrélation clinique avec les antécédents du patient et d’autres informations de diagnostic est nécessaire pour déterminer le statut infectieux du patient. Des résultats positifs n’excluent pas une infection bactérienne ou une co-infection avec d’autres virus. L’agent détecté peut ne pas être la cause définitive de la maladie.[2]