PCR-testen

Voor een onderbouwde visie met betrekking tot testen tracht Luchtvaart Covid Collectief belanghebbende partijen met dit document meer informatie te verschaffen over de gebruikte diagnostische methoden. PCR is het fundament van de genomen maatregelen met betrekking tot het SARS-CoV-2 virus. De PCR-test vormt de basis voor de statistieken van het aantal positieve testen, besmettelijke personen, R-waarde, ziekenhuisopnames, IC-opnames, sterfgevallen en de vele modellen. Alle vormen van testen zijn geijkt aan PCR.

Het fundament kan dan maar beter ijzersterk zijn. Basiskennis en begrip van PCR en met name van de beperkingen van PCR, zal doen begrijpen dat we op vele vlakken bochten aan het afsnijden zijn. Dit heeft enorme maatschappelijke gevolgen.

Wat is ‘PCR’?

De afkorting PCR staat voor ‘polymerase chain reaction’, een polymerasekettingreactie. Het is een techniek die in diverse laboratoria gebruikt wordt. Met deze techniek kunnen onderzoekers een minuscule hoeveelheid DNA vermeerderen, tot er genoeg van is om te detecteren, onderzoeken, gebruiken of te analyseren. De ontdekking van PCR heeft bijvoorbeeld forensisch onderzoek enorm vooruitgeholpen. PCR is kort gezegd, een laboratoriumtechniek.

Hoe werkt het?

Met PCR kan specifiek genetisch materiaal (een stukje DNA) worden verdubbeld door middel van een gecontroleerde temperatuurverhoging en –verlaging. Deze verdubbelingstap heet een ‘cycle’. Hoe meer cycles uitgevoerd worden, des te meer kopieën er ontstaan van het stukje DNA. Iedere cycle levert daarmee een exponentiële toename op van de hoeveelheid genetisch materiaal.

Om aan te geven hoe snel het aantal vermeerderingen gaat ten opzichte van de hoeveelheid beginmateriaal:

• 1 cycle: 2 x zoveel materiaal;
• 2 cycles: 4 x
• 10 cycles: 1024 x
• 20 cycles: 1.048.576 x
• 30 cycles: 1.073.741.824 x
• 40 cycles: 1.099.511.627.776 x
• 45 cycles: 35.184.372.088.832 x

Door middel van PCR is een niet-detecteerbare hoeveelheid DNA te vermeerderen tot een detecteerbare hoeveelheid. Is er DNA aanwezig waarnaar je opzoek bent? Dan ga je dat met PCR kunnen vinden.

Omdat het SARS-CoV-2 virus een zogenaamd RNA-virus is, dient dit RNA door enzymen omgezet te worden in DNA alvorens vermenigvuldigd te kunnen worden. Het enzym dat hiervoor zorgdraagt heet ‘reverse transcriptase’ (RT). Om die reden wordt in het geval van vermeerdering van RNA-virusmateriaal gesproken over RT-PCR.

Wat toont PCR aan?

Een ‘positieve’ PCR-test is de bevestiging dat er een stukje DNA (gen) in het monster van de geteste persoon zat. Er wordt getest op ‘aanwezigheid’ van een gen op de eerste verdedigingslinie van het lichaam, de slijmvliezen. Niets meer, niets minder.

Het aantal cycles dat benodigd is alvorens het specifieke gen gedetecteerd kan worden, heet de ‘cycle threshold’ ofwel de Ct-waarde. De Ct-waarde geeft zo een indicatie voor de hoeveelheid van het gezochte gen in het afnamemonster. Bij een lage Ct-waarde (minder cycles) was er in beginsel meer van het gezochte gen aanwezig. Zijn er veel cycles benodigd alvorens het gen gedetecteerd kon worden, dan was de beginhoeveelheid klein.

Wat toont PCR niet aan?

De kern van het SARS-CoV-2 coronavirus bestaat uit RNA, opgebouwd uit vele genen. Onder andere N-, S-, E-, RdRP- en ORF1a/b-genen.[1] De detectie van een enkel stukje gen, bijvoorbeeld E-gen, betekent niet dat alle andere noodzakelijk genen, benodigd voor een intacte RNA-kern, óók aanwezig zijn. De RNA-kern van het coronavirus wordt omgeven door een eiwitmantel. Ook deze wordt niet gedetecteerd door PCR. PCR toont dus nooit per definitie intact virus aan.

Een positieve test zegt ook niet of het virus daadwerkelijk jouw cellen is binnengedrongen en ook niet of het virale materiaal zich actief vermenigvuldigt. Zonder uit te sluiten of er mogelijk andere pathogenen (bijvoorbeeld andere virussen) aanwezig zijn, kan de oorzaak van klachten niet toegewezen worden aan enkel een positieve PCR uitslag. Ook zegt een positieve test niet of je besmettelijk bent voor een ander.

Een PCR-testuitslag is daarmee nadrukkelijk op zichzelf geen klinische diagnose. De fabrikanten van PCR-testkits zijn hier heel duidelijk over in de gebruiksinstructies:

“Positive results are indicative of the presence of SARS-CoV-2 RNA; clinical correlation with patient history and other diagnostic information is necessary to determine patient infection status. Positive results do not rule out bacterial infection or co-infection with other viruses. The agent detected may not be the definite cause of disease.” [2]